Учениками ЛНМО могут стать дети, мотивированные к обучению одновременно по учебному плану основного общего образования и центра дополнительного образования, желающие получить качественное образование для построения карьеры ученого или специалиста в наукоемких областях производства. Ученики, поступающие в 5-е и 7-е предпрофильные классы, проходят вступительные собеседования, а их родители при поступлении ребенка в специализированные классы государственной школы и в ЧОУ ОиДО «ЛНМО» подписывают заявление об обучении в рамках интеграции программ общего и дополнительного образования, по расширенному учебному плану.